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短信全部消失可能有以下几种原因。
1、可能是手机设置问题，可以在手机设置中查看短信是否全部清除或者设置了自动删除短信的功能，如果是这种情况，可以重新设置短信保存功能。
2、可能手机存在病毒或安装了恶意软件，这些软件可能会删除手机中的短信，可以尝试使用手机安全软件进行扫描和清除病毒。
3、手机硬件问题也可能导致短信消失，例如手机内存不足或者存储空间已满等问题，此时可以尝试清理手机内存或购买更大的存储空间。
4、手机系统问题也可能导致短信消失，可以尝试重启手机或恢复出厂设置来解决这个问题，如果仍无法解决，可能需要考虑进行系统升级或联系手机制造商的客服寻求帮助。
如果使用的是第三方短信应用，也有可能是应用本身的问题导致的短信消失，可以尝试卸载并重新安装该应用，或者尝试使用其他短信应用，检查是否达到了短信存储容量的上限，如果是的话，删除一些不需要的短信即可。
无论哪种原因造成短信消失，都要谨慎处理，避免重要信息的丢失，如果无法自行解决问题，建议寻求专业技术人员的帮助。